Una prueba de PCR para Apendicitis

 Para el medio ambiente, esta semana realicé lo siguiente: 

En la apendicitis, se ha observado la presencia de bacterias que forman parte de la microbiota normal pero que han desarrollado cepas con mayores factores de virulencia, lo que puede causar complicaciones. Un ejemplo de ello es la Escherichia coli O157 (1). Para detectar esta bacteria, se pueden utilizar muestras de tejido del apéndice extirpado durante la cirugía o muestras de heces. En ambos casos, se realiza una extracción del ácido nucleico (ADN) utilizando diferentes kits, como el IsoQuick. El objetivo de la extracción es aislar y purificar completamente el ADN (2).

En cuanto al tipo de PCR que se puede utilizar, tanto el PCR convencional como el PCR en tiempo real (qPCR) son opciones válidas. Sin embargo, el PCR convencional suele ser preferido debido a su menor costo, y una diferencia de tiempo no tan significativa con respecto al qPCR (alrededor de una hora); se amplifican secuencias específicas de los genes stx1, stx2 y rfbE. Además, se utiliza el gen ARNr universal 16S como control positivo para las enterobacterias (2)

En cuanto a los resultados, estos varían según la PCR utilizada. En el caso del PCR convencional, se obtienen resultados cualitativos que determinan la presencia o ausencia de la cepa bacteriana. También se pueden obtener resultados semicuantitativos, debido a que no proporcionan cantidades numéricas exactas del fragmento amplificado. Por otro lado, el qPCR ofrece resultados tanto cuantitativos como cualitativos de manera precisa, gracias al uso de sondas específicas (2).

Imagen obtenida de: https://www.cirugiaqz.es/wp-content/uploads/2020/06/apendicitis-aguda-zaragoza.jpg

Referencias bibliográficas:

1. Belgacem A, Miane H, Fillali W, Hangard P, Ponthier L, Ballouhey Q. Síndrome urémico hemolítico después de apendicitis complicada en un niño: ¿cuál es el eslabón perdido? J Int Med Res [Internet]. 2021 [citado el 1 de julio de 2023];49(4):3000605211006952. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1177/03000605211006952

2. Yepes-Pérez M, Carrero K, Vásquez N, Correa E. Validación de PCR convencional para detectar E. coli O157. CIT Inform Tecnol [Internet]. 2022 [citado el 1 de julio de 2023];33(2):3–12. Disponible en: https://www.scielo.cl/scielo.php?pid=S0718-07642022000200003&script=sci_arttext